实时定量PCR的具体操作步骤是什么?
时间: 2025-05-16 15:31:17
实时荧光定量PCR(qPCR)的具体操作步骤可分为以下关键环节,结合不同实验场景的优化要点:
一、样本制备
RNA提取
裂解细胞:使用TRIZOL或NucleoZol裂解样本,室温静置溶解。
两相分离:加入氯仿振荡离心,RNA分布于水相上层。
RNA沉淀:水相与异丙醇混合离心,75%乙醇清洗沉淀。
溶解保存:DEPC水溶解RNA,-80℃保存。
DNA去除(可选)
使用DNase I处理RNA样本,65℃灭活后电泳验证。
二、反转录(RT)
体系配置
模板RNA(1μg)、逆转录酶、dNTPs、Oligo(dT)或随机引物。
反应程序
42℃ 60分钟(Oligo(dT))或25℃→42℃分步反应(随机引物)。
三、qPCR反应体系
组分 体积/浓度 备注
cDNA模板 1-5μL 稀释至合适浓度
引物(10μM) 各0.5-1μL 产物长度80-150bp
SYBR Green Mix 10-12.5μL 含荧光染料和Taq酶
RNase-free水 补足至20-25μL 避免降解
四、上机运行程序
扩增条件
预变性:95℃ 30秒(激活酶)。
循环阶段:95℃ 5秒→60℃ 30秒(40-45循环)。
熔解曲线分析
60℃→95℃逐步升温,验证产物特异性(SYBR Green法必需)。
五、数据分析
阈值设定
荧光信号阈值通常设为基线标准偏差的10倍。
Ct值解读
Ct值与起始模板量成反比,通过标准曲线或ΔΔCt法定量。
注意事项
防污染:分区操作(样本制备、PCR配制、扩增区)。
引物验证:避免二聚体,可通过电泳或熔解曲线检查。
内参基因:选用GAPDH或β-actin等稳定表达基因校正。
如需特定样本(如血液、植物组织)的优化方案,可进一步细化需求。
